York University Phenology Project - ITS2, library #2, >0.99 barcode matches

Событие
Последняя версия опубликовано Test Organization #1 окт. 9, 2024 Test Organization #1
Дата публикации:
9 октября 2024 г.
Опубликовано:
Test Organization #1
Лицензия:

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 2 421 Записи в English (164 KB) - "частота обновления": ежедневно
Метаданные в формате EML Скачать в English (6 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (6 KB)

Описание

The York University Phenology Project evaluated the utility of managed honey bee (Apis mellifera) colonies as bio-monitors of plant community phenology. Using Amro Zayed's urban apiary as the study site, pollen traps were installed at the base of 5 honey bee colonies, and pollen was collected weekly during a 24 hr. sampling period for 15 weeks. On-site field monitoring of plants in flowering was simultaneously completed using a 1000 m. radius around the study site. Collected pollen samples were split into two libraries, each of which underwent two-locus metabarcoding using ITS2 and rbcL1, yielding 4 total metabarcoding libraries. This metabarcoding library contains ITS2 ASVs for weeks 5 – 15 that were matched to a MetaCurator reference barcode with a >0.99 similarity threshold. Metabarcoding methods were independently validated and are described here: https://link.springer.com/article/10.1186/s13007-023-01097-9 The study site was urban, featuring many ornamental plantings of non-native species, and mixed-wood lots of native and invasive species.[This dataset was processed using the GBIF Metabarcoding Data Toolkit.]

Записи данных

Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 2 421 записей.

Также в наличии 1 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.

Occurrence (core)
2421
dnaDerivedData 
2421

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Test Organization #1. This work is licensed under a <a href="https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/">https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/</a>.

Регистрация в GBIF

Этот ресурс не был зарегистрирован в GBIF

Ключевые слова

Occurrence

Контакты

Sydney Wizenberg
  • Metadata Provider ●
  • Originator ●
  • Point Of Contact
  • Postdoctoral Fellow
Naturalis Biodiversity Center
Leiden
NL
Amro Zayed
  • Originator
  • Professor
York University
Toronto
Ontario
CA
Mateus Pepinelli
  • Originator
  • Professor
Laurentian University
Sudbury
Ontario
CA
Ida Conflitti
  • Originator
  • Project Manager
York University
Toronto
Ontario
CA

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы https://ipt.gbif-uat.org/resource?r=mdt-upload